More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3401 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  54.67 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  37.86 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.39 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  35.63 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  37.6 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  33.02 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  31.58 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  30 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.64 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  31.71 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  28.3 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0432  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  21.62 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  21.43 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  32.9 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>