More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1193 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 347 aa  639    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  39.76 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  35.58 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  37.64 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  34.97 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  37.27 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.63 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 301 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 307 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 308 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 306 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.04 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 315 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.43 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  32.98 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 304 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 301 aa  89.7  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  32.48 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0352  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.21 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0370  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001984  HTH-type transcriptional regulator IlvY  22.71 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0432  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  43.75 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>