More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5452 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  58.25 
 
 		 288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 288 aa  309  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  51.41 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  47.7 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  47.02 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  32.78 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.23 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  28.96 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.7 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.05 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2760  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00129755  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3737  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4814  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 314 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  24.4 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  33.93 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  30.36 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5965  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0576334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>