More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0432 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0432  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  83.06 
 
 		 307 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  42.43 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.61 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  30.24 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  33.46 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.46 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1473  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1497  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1472  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2901  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3143  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0541  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2571  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1887  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2712  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.28 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3521  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.59 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.32 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2722  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.604965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>