More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2292 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 315 aa  600  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40.57 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  41.35 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  40 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  39.69 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.18 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.9 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.15 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.85 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  35.37 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>