More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3621 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  597  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0432  transcriptional regulator, LysR family  83.06 
 
 		 307 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  42.2 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.93 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  33.46 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.99 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.37 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.01 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  38.66 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  28.52 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2318  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6901  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4146  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1190  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>