More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1190 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1190  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  60.07 
 
 		 293 aa  334  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  46.61 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  46.83 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  40.29 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  40.29 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  38.68 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  38.68 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  38.68 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.02 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  38.33 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  41.7 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  38.68 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.21 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  39.11 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  32.99 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  32.99 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1893  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  32.51 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  32.51 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  32.51 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  32.51 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  32.51 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  35.63 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  32.31 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.18 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  32.29 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4763  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3583  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  35.77 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>