More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2446 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  47.49 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  37.13 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.11 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  39.73 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.35 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.22 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  31.65 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  31.87 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  32.69 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  33.75 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  31.47 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  31.87 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  35.27 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>