More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0129 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 315 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  54.03 
 
 		 316 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  52.3 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  46.82 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  46.55 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 		 331 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.22 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  39.94 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.34 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.4 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  35.16 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.71 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  36.26 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  39.23 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  34.49 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.47 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.6 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  33.22 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>