More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6522 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  577  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  61.36 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  44.7 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  43.81 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  42.39 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  37.63 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  39.41 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  39.47 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.35 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  39.02 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  38.58 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  38.58 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  39.84 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.44 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  24.24 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>