More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0582 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  603  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  62.58 
 
 		 314 aa  352  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  55.23 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  57.24 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.3 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.72 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  34.45 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.87 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  33.98 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.77 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  49.57 
 
 		 347 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>