More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3675 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  597  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  85.62 
 
 		 311 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  52.07 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  44 
 
 		 316 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  42.06 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  41.01 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  30.47 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  31.69 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  24.72 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  28.67 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 334 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 375 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  28.11 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>