More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2541 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  603  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  47.16 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  43.85 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  40.75 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36530  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3938  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0402933  decreased coverage  0.000431785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.5 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.91 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  33.06 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 302 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  32.53 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  29.34 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.19 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.33 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  28.97 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  29.61 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  32.6 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  42.25 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13090  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.393584  normal  0.531505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  30.27 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3187  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  47.47 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  26.4 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  29.04 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0860  transcriptional activator MetR  25.82 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>