More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1309 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  83.06 
 
 		 303 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  59.34 
 
 		 305 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  53.69 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3938  transcriptional regulator, LysR family  51.34 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0402933  decreased coverage  0.000431785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36530  transcriptional regulator  48.77 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  40.49 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 311 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  33.45 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  30.6 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  26.85 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  29.03 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.11 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  24.47 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  25.69 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  28.09 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6646  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636904 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  25.69 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  23.13 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  27.64 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13090  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.393584  normal  0.531505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  22.44 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  22.05 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>