More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1352 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  83.06 
 
 		 302 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  60.86 
 
 		 305 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  55.7 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3938  transcriptional regulator, LysR family  51.34 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0402933  decreased coverage  0.000431785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36530  transcriptional regulator  48.78 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  41.34 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  33.78 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  30.64 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 331 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.6 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  29.36 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  27.81 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  27.97 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  30.4 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.91 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  21.95 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  28.89 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  25.09 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  29.69 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  23.93 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  25.69 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  27.38 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  22.7 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  26.4 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>