More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3228 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  98.05 
 
 
308 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  98.05 
 
 
308 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  98.05 
 
 
308 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  97.4 
 
 
308 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  97.73 
 
 
308 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  97.4 
 
 
308 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  87.62 
 
 
307 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  86.64 
 
 
307 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3760  transcriptional regulator, LysR family  76.49 
 
 
320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0176  LysR family transcriptional regulator  76.25 
 
 
334 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  76.59 
 
 
319 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4084  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
302 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1795  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00491108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  46.18 
 
 
295 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  46.18 
 
 
295 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  46.18 
 
 
295 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  46.18 
 
 
295 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  46.18 
 
 
295 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
311 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4429  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 
295 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353494  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  47.02 
 
 
295 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 
311 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 
311 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1401  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 
297 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.025944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1336  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 
297 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.916876  normal  0.272272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0291  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
292 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 
302 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 
300 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
297 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
293 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
295 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.1 
 
 
298 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 
295 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  38.75 
 
 
294 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  38.75 
 
 
294 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  32.19 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  34.95 
 
 
294 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 
294 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0420  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
296 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0894  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
298 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
294 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
293 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
295 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3390  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0974  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.966458  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0953  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0988  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
296 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
296 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
293 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
295 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
295 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
295 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0901  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
302 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000228882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1046  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
296 aa  175  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0884  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000164987  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3026  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
296 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0921  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
296 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3051  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
296 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000517942  normal  0.0334887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1324  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
293 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0828  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
297 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
302 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0340  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0324  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2928  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
296 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0645759  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
298 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
307 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
300 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 
300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 
300 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
305 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
300 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
300 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 
300 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 
301 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
317 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>