More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1740 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  588  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  68.46 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  64.41 
 
 		 327 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  54.4 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  41.34 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  37.38 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  39.39 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  40.38 
 
 		 302 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  40.31 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  37.69 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.44 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  37.77 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  39.2 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  36.58 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.6 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0727  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.849989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  38.42 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  34.73 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  35.74 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.06 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.44 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>