More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1027 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 305 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  60.86 
 
 		 303 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  59.34 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3938  transcriptional regulator, LysR family  49.16 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0402933  decreased coverage  0.000431785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36530  transcriptional regulator  46.18 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  39.21 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  33.09 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  27.99 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  32.81 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  30.92 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  23.99 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  30.42 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  26.24 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  28.84 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  26.53 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  29.14 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  22.98 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  24.65 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0510  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.238537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  24.15 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  24.15 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  29.22 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  27.27 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>