More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0510 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0510  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.238537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16950  transcriptional regulator  45.72 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  25.96 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.35 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1831  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  25.34 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1369  transcriptional regulator, LysR family  24.74 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  25.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.45 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27000  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  24.66 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  24.66 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  27.04 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  24.66 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0633  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  24.66 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  24.66 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  31.22 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1334  LysR substrate-binding  25.93 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.622556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  27.24 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  27.37 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  25.95 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  27.51 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0921  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1258  transcriptional regulator, LysR family  24.8 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000639687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  24.37 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0974  transcriptional regulator, LysR family  22.71 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.966458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2558  DNA-binding transcriptional activator XapR  24.41 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000632847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  30.31 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3390  LysR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  29 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3051  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000517942  normal  0.0334887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>