More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  100 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  91.08 
 
 		 314 aa  544  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  89.04 
 
 		 306 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  89.04 
 
 		 306 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 313 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 313 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  79.94 
 
 		 314 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  86.04 
 
 		 310 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  79.94 
 
 		 314 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  80.13 
 
 		 313 aa  501  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  84.83 
 
 		 301 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  82.64 
 
 		 314 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  81.53 
 
 		 320 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  81.94 
 
 		 312 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  79.74 
 
 		 331 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  76.75 
 
 		 326 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  75 
 
 		 304 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  72.55 
 
 		 308 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  72.95 
 
 		 304 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  74.83 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  70.3 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  63.95 
 
 		 294 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  56.29 
 
 		 302 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 303 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 296 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 296 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  51.55 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  50.33 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  51.88 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  71.43 
 
 		 151 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.16 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.72 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3345  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 286 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.47 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  33.47 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  33.47 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  33.47 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  33.47 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  43.92 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  37.88 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  38.08 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.25 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>