90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0808 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  72.79 
 
 		 314 aa  210  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 313 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 313 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  75.38 
 
 		 314 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  71.53 
 
 		 306 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  71.53 
 
 		 306 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  67.35 
 
 		 314 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  65.54 
 
 		 331 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 313 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 310 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  72.87 
 
 		 314 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 320 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 326 aa  184  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  69.77 
 
 		 314 aa  183  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  69.84 
 
 		 304 aa  180  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  67.94 
 
 		 312 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  69.05 
 
 		 304 aa  179  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 301 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 308 aa  174  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 303 aa  174  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  70.77 
 
 		 308 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  61.76 
 
 		 304 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  57.69 
 
 		 294 aa  151  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  49.22 
 
 		 277 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  50.78 
 
 		 302 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 296 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 300 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 296 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 303 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 296 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 296 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  45.97 
 
 		 302 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 302 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  43.08 
 
 		 249 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  44.36 
 
 		 317 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 303 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 245 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 213 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 307 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 296 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 213 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 306 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.35 
 
 		 300 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 300 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  32.98 
 
 		 313 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2473  LysR, substrate-binding  25.2 
 
 		 345 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  0.35717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 298 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 304 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 304 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 328 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 328 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 301 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  35.05 
 
 		 297 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 299 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 313 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 304 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2541  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 302 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0606  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 305 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>