69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1134 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  65.24 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  64.76 
 
 		 213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 218 aa  267  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  63.85 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  33.5 
 
 		 302 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  33.5 
 
 		 294 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 317 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 296 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 302 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 314 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 303 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 310 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 277 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  31.19 
 
 		 314 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 320 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 301 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 306 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 306 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 313 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 313 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 304 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 313 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 326 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 308 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 312 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  31.25 
 
 		 314 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  29.33 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  29.93 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 297 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1002  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  28.27 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0498  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  28.71 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0173  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 318 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.569723  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  20.15 
 
 		 302 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13090  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 311 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.393584  normal  0.531505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2564  nitrogen assimilation transcriptional regulator  28.49 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000767636  normal  0.0977076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0946  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0379301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 303 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 289 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.37 
 
 		 292 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7451  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 295 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193814  normal  0.890359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>