More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1229 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  77.95 
 
 		 296 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  77.08 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  79.92 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  80.08 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  55.6 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  55.6 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  53.94 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  55.65 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 314 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  54.62 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  51.81 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  54.62 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  53.82 
 
 		 314 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  53.01 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  49.6 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  51.61 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  54.25 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  47.39 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  48.39 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  47.2 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  48.05 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  43.24 
 
 		 249 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  48.41 
 
 		 151 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2121  putative transposase  100 
 
 		 530 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3612  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.11 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  28.11 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.16 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  32.03 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  28.11 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  27.24 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  27.24 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  27.24 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 213 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3345  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 308 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  27.44 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.82 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0657  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>