More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4374 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  57.35 
 
 		 308 aa  332  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  46.09 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  42.58 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 302 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  42.97 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  40.23 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  40.23 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  40.08 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  39.84 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  40.5 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  40.08 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  37.22 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  34.57 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  34.57 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  34.57 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  35.83 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0038  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  38.55 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  31.23 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  41.01 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  38.55 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  38.55 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  32.41 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  32.41 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  38.55 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  38.55 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  38.55 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>