More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2807 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  69.86 
 
 		 303 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  65.31 
 
 		 306 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  65.31 
 
 		 306 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  66.55 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  66.21 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  63.67 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 313 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  63.95 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  63.95 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  63.61 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  61.64 
 
 		 314 aa  359  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 310 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  62.93 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  63.61 
 
 		 313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  61.56 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 326 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  57.53 
 
 		 304 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 304 aa  338  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 296 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 296 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  56.8 
 
 		 308 aa  323  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 296 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  55.56 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 302 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  54.17 
 
 		 302 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  56.46 
 
 		 304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 303 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  58.69 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  57.69 
 
 		 151 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  39.75 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.51 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  47.22 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  34.8 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.54 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  32.4 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  39.34 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  31.71 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  31.71 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.27 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  31.71 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3128  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>