98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1220 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 213 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  64.53 
 
 		 217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 		 294 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 303 aa  99  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 302 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 296 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 312 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 317 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 277 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 308 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 310 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  29.85 
 
 		 314 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 304 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  29.85 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 320 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  28.14 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 331 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 308 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3211  LysR substrate-binding  34.65 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.847319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3535  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3406  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 336 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 306 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  24.49 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 327 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 297 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13090  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.393584  normal  0.531505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 319 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 313 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2313  LysR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3127  hypothetical protein  27.75 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.339021 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  27.7 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0498  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  24.14 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.63 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3180  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000913233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 304 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0956  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 306 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 333 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 298 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 294 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 311 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 322 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  24.53 
 
 		 296 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 305 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 302 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7451  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 295 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193814  normal  0.890359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>