60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2874 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  70.19 
 
 		 208 aa  294  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  69.54 
 
 		 197 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  66.35 
 
 		 208 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 302 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 317 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 302 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 303 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 296 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 306 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 306 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  28.78 
 
 		 314 aa  88.2  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 277 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 296 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  28.5 
 
 		 294 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 308 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 304 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  27.8 
 
 		 314 aa  84.7  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  27.45 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  29.95 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  27.72 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  32.17 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  25.75 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 306 aa  48.5  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.38 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0719  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0899  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 278 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.37 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2797  regulatory protein, LysR  29.5 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.454045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>