More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0719 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0719  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0899  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3019  regulatory protein, LysR  40.68 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4058  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2797  regulatory protein, LysR  40.23 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3712  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0481  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.863841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3686  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4140  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4324  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  25.28 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1312  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3265  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  28.15 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1646  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1615  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.760983  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2160  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  29.37 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  25.38 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3612  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 332 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11328  normal  0.0439826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  28.62 
 
 		 306 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.98 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  28.62 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  28.62 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  28.62 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  28.62 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  28.62 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  28.62 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1893  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.62 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3648  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  26.82 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  26.33 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.57 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  26.59 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.93 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  26.75 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  24.49 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  24.33 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  25.4 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  26.33 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  26.69 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>