More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0481 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0481  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.863841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3686  LysR family transcriptional regulator  90.55 
 
 		 279 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4140  LysR family transcriptional regulator  87.73 
 
 		 273 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4324  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0719  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0899  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4058  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3712  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1312  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2797  regulatory protein, LysR  33.77 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3019  regulatory protein, LysR  32.89 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3265  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1816  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1615  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.760983  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0713  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4009  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.671239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8089  transcriptional regulator, LysR family  26.75 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0337  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0334498  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2160  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.17 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  32.28 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  32.28 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  32.28 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  32.28 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5622  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.2 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  31.58 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  31.58 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  31.58 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  25.69 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1311  transcriptional regulator-like protein  28.12 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000442274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3612  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11328  normal  0.0439826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  25.81 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.21 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.21 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.72 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1131  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  20.82 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>