More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1131 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1131  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  593  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  57.84 
 
 		 295 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6475  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  57.49 
 
 		 295 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6467  regulatory protein, LysR  54.13 
 
 		 228 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.51 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3345  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  31.71 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  31.71 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  31.71 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  31.71 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  31.71 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  37.96 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  37.13 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  37.13 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  37.13 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  37.13 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  37.13 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  37.13 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  36.76 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  37.13 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  38.55 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 289 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  36.07 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  36.43 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.06 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.7 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  34.03 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  32.65 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>