More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0337 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0337  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0334498  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1943  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  35.59 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  35.59 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  35.59 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.59 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.59 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  39.77 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 296 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0657  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  38.15 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  36.55 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  34.34 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  34.34 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  34.34 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  34.34 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.96 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  32.83 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  35.06 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>