More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3648 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3648  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  73.29 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 312 aa  278  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  46.51 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 339 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  45.68 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2386  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5863  Transcriptional regulator  44.6 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2482  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.2 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6877  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5839  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5762  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  29.2 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.74 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.56 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.56 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  31.84 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0441  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  31.69 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.47 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.82 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.61 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 418 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  33.84 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.47 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>