More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  99.35 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  85.2 
 
 		 304 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  83.39 
 
 		 301 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  82.72 
 
 		 303 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  82.39 
 
 		 313 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  82.72 
 
 		 317 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  81.73 
 
 		 309 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  81.46 
 
 		 309 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 307 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 307 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  80.07 
 
 		 309 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0441  LysR family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.8 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2639  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 418 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3374  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798334 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3466  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0682  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.670623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2653  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2609  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1043  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.805531  normal  0.622996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4264  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.85 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3404  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  30.03 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4286  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.255291  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5863  Transcriptional regulator  29.15 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6877  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2482  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5762  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5839  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3648  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2386  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  28.47 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1543  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1730  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1032  regulatory protein, LysR  28.09 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1049  regulatory protein, LysR  28.09 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2833  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2815  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5176  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1916  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.61 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>