More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3404 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3404  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0441  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4264  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4286  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.255291  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1043  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.805531  normal  0.622996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.37 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3466  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2639  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3374  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2653  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2609  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  28 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.76 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5863  Transcriptional regulator  25 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 319 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  25.54 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0682  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.670623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2386  transcriptional regulator, LysR family  25.27 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5839  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3648  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.18 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1032  regulatory protein, LysR  27.46 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1049  regulatory protein, LysR  27.46 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  22.64 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.44 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  26.87 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2482  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6877  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0711  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  23.45 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>