More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1043 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1043  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.805531  normal  0.622996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  41.15 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2639  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2609  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2653  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.28 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0441  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3466  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3374  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4264  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3404  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.07 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0682  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.670623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.51 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.06 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.3 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5863  Transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4286  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.255291  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.97 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.67 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.77 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  32.01 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.77 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.77 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.98 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  30.43 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  30.64 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  30.03 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>