More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2653 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2609  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2653  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2639  LysR family transcriptional regulator  98.87 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  35.02 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4934  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  39.69 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1043  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.805531  normal  0.622996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 418 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.88 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3023  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3374  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1171  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0441  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 307 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0144  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4264  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0682  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.670623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4286  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.255291  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3466  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3404  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  37.86 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  33.61 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  27.17 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 304 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 295 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 306 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0131  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 307 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.33 
 
 		 305 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1183  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3552  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5762  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  31.15 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 315 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  37.96 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.64 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>