50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2169 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  88.94 
 
 		 208 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  82.74 
 
 		 197 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  68.27 
 
 		 208 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  69.71 
 
 		 208 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 302 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 308 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 303 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  34.15 
 
 		 314 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  32.7 
 
 		 314 aa  95.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 314 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 331 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 326 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 304 aa  88.6  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 314 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 294 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 308 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 320 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 310 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  31.1 
 
 		 314 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  33.17 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  34.27 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  22.39 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>