131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1344 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  64.76 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  64.76 
 
 		 213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  61.35 
 
 		 218 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  59.9 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 304 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 296 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  31.98 
 
 		 314 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  32.49 
 
 		 314 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 302 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 304 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 313 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 310 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 317 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 312 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 303 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 296 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 302 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  29.95 
 
 		 314 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 313 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 306 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 306 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 314 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 303 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 320 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 313 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 308 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 302 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  31.11 
 
 		 314 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 301 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 296 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  29.85 
 
 		 277 aa  85.5  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  27.45 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  27.61 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 302 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 323 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 364 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 297 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.07 
 
 		 304 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 311 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.7 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 305 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  24.52 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  27.86 
 
 		 297 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4767  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 313 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  27.45 
 
 		 299 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1922  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 322 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 303 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 301 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 310 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 327 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  28.3 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2391  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0830106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1500  LysR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0884  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000164987  normal  0.231561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.17 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  25.71 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5863  Transcriptional regulator  25.38 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>