60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0930 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  88.94 
 
 		 245 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  88.32 
 
 		 197 aa  352  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  70.19 
 
 		 208 aa  294  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  69.23 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 302 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 313 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 312 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 304 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 302 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 303 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 313 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  29.81 
 
 		 314 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  31.19 
 
 		 314 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 306 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 306 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 277 aa  91.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 314 aa  90.9  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 331 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 313 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 304 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 326 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 302 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 296 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 308 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 294 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 320 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  27.88 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 304 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  34.29 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 300 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.15 
 
 		 297 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 306 aa  45.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  27.81 
 
 		 310 aa  45.1  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 310 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1500  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.88 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2489  transcriptional regulator, LysR family  25.14 
 
 		 293 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>