62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2407 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2407  transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0930  transcriptional regulator, LysR family  88.32 
 
 		 208 aa  352  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2169  LysR family transcriptional regulator  82.74 
 
 		 245 aa  333  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2874  transcriptional regulator, LysR family  69.54 
 
 		 208 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0696  transcriptional regulator, LysR family  70.05 
 
 		 208 aa  274  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 302 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 317 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 304 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 313 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35850  Regulatory protein, LysR-family  33.51 
 
 		 314 aa  95.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0402658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3710  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 312 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0404575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 306 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 306 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  35.26 
 
 		 304 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30970  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 331 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030684  unclonable  5.74685e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 296 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35760  LysR family regulatory protein  31.77 
 
 		 314 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4191  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 303 aa  89  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530401  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1314  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 308 aa  88.6  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1002  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 277 aa  87.8  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2000  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 313 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 301 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1336  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 320 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00681412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 294 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2400  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000468465  hitchhiker  0.00000339516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 314 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1546  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 326 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00132043  normal  0.724965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3462  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1891  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2346  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3723  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 310 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2588  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3037  LysR, substrate-binding  35.71 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.45113  normal  0.372125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1229  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  29.65 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2641  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.999416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1344  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1220  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.734028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3464  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0808  transcriptional regulator  36 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2402  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000498795  hitchhiker  0.00000317768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1134  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4211  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1668  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.41 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  28.86 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 306 aa  44.7  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.4 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1451  transcriptional regulator, LysR family  25.15 
 
 		 319 aa  42  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0712  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 299 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 301 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7257  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2489  transcriptional regulator, LysR family  25.71 
 
 		 293 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>