More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2277 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  599  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  51.06 
 
 		 288 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  49.43 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  49.43 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2014  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382671  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  46.67 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  43.55 
 
 		 291 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.89 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  44.91 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  41.97 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  39.84 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.87 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0630  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6654  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  34.7 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3299  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  35.04 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0843  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4562  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0821586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4722  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0824  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  32.22 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3510  LysR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2414  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0272  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2067  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0408016  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  25.27 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  26.13 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>