More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2363 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  613  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  83.83 
 
 		 305 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  30.03 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  26.98 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 458 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  26.1 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  25.64 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.24 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  25.88 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  21.72 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  27.5 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  28.88 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  24.72 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  29.66 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  26.91 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  24.72 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3293  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1323  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3615  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  31.99 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  26.55 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  29.53 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>