More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4703 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  99.32 
 
 		 294 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  52.43 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2240  LysR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  47.5 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3964  transcriptional regulator, LysR family  47.5 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00150668  normal  0.033592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3231  transcriptional regulator, LysR family  45.52 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.421625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4065  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1363  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0881  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4146  LysR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  44.88 
 
 		 288 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1341  LysR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545162  normal  0.0460764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2074  LysR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5878  transcriptional regulator, LysR family  44.85 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2929  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.03 
 
 		 290 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000376093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2014  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382671  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  44.04 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4905  putative LysR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00441942  hitchhiker  0.00167298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  45.53 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0288  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0307  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0158849  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  40.76 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6165  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0309424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3893  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.199081  normal  0.0200217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0817  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1639  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3299  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2540  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0630  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0912  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  37.9 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2414  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5611  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4562  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0821586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06369  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3510  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0843  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0468  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3484  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.719553  normal  0.357365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0824  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6654  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2067  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0408016  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1265  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  26.77 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4722  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.422329  normal  0.859213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4410  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0548  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.92 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>