More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4593 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  52.04 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  31.29 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 327 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0263  putative transcriptional regulator  23.1 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.95 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0119  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.29 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  26.3 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.29 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  29.15 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2086  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal  0.654508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3816  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.898253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1787  LysR family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000671509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  28.41 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  26.51 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1767  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  27.46 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0392  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3132  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4467  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0400691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>