More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2323 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2086  transcriptional regulator, LysR family  83.06 
 
 		 307 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal  0.654508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  35.84 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4564  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53731  normal  0.180488 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  34.89 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  30.26 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2472  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.6 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3012  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  30.6 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.450438  hitchhiker  0.000703378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2570  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  35.68 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0281  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  33.21 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4069  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2757  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  32.56 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  33.74 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 699 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3816  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.898253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  32.85 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3414  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3577  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>