More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4073 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 313 aa  584  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  41.02 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  44.04 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  39.55 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  40.92 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  33.9 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  36.47 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.6 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  39.22 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  39.89 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  34.7 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 310 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.07 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  33.57 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.2 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5092  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.22 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4974  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1309  transcriptional activator MetR  30.53 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00130868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  28.29 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1338  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 311 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 328 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 323 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15210  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.017601  hitchhiker  0.00000000286911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.33 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  31.73 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3955  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.81 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  22.48 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4404  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>