More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1602 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  641    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  33.93 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  30.82 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  30.79 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 350 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  28.3 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  27.81 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  26.26 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  27.52 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  24.41 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  26.58 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  26.8 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  26.8 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  26.8 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  26.88 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3210  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  25.49 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  26.6 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  27.62 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>