More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1443 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1443  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 314 aa  608  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  30.92 
 
 		 331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5461  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.151459  normal  0.0638444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.55 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.24 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2004  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4331  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  30.08 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5219  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.73 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  23.92 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.55 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.57 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  23.53 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.96 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  33.74 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  24.73 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6114  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  34.82 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  24.38 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  29.67 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 329 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.51 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4318  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.772143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  22.92 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.71 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  30.86 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  25.09 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3226  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>