More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5461 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5461  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.151459  normal  0.0638444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2661  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1443  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 283 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  26.16 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  24.89 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  28.14 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  26.39 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  31.15 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2130  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.27 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.809904  hitchhiker  0.00950877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  24.8 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.47 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1674  transcriptional regulator, LysR family  26.05 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  25.63 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3527  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4331  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  23.37 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09570  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0895  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  24.73 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0811  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0879  transcriptional regulator, LysR-family  28.69 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  29.55 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  23.26 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  24.73 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1242  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001561  transcriptional regulator LysR family  30.88 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.12 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.01 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5092  LysR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>