More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4317 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4317  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 293 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  35.61 
 
 		 699 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  26.92 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  33.57 
 
 		 330 aa  99  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.43 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2434  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.19 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  30.58 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0918  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0210  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  28.9 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.9 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.9 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0978  LysR substrate-binding  29.89 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5127  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.93 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.9 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  28.9 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.93 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.9 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.93 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.93 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.93 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0942  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0548  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  28.9 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0004  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3560  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0436094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2215  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.50368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>